Bonjour,
Jai des donnees de genotypage c’est à dire une liste d’individus (ligne) et des marqueurs en colonne.
Pour chaque colonnes, un individu peut deux valeurs. Par explempe
Ligne 1 Colonne 1 : A ou G
Ligne 1 colonne 2: C ou T
Ect…
Jai besoin de remplacer chaque valeur par 1 et 2. Peut importe lequel est 1 ou lequel est 2.
Pour l’instant je n’ai ps trouver de solution rapide , alors je selectionne les colonnes dans lesquels peuvent y avoir A ou G, par exemple, et je fait rechercher remplacer, A par 1 et G par 2.
Mais j’ai des millier de colonnes…
Je ne sais pas si c’est bien clair, je ne peux pas sélectionner le tableau entier et replacer tout les G par 1, les T par 2, les C par 1, les A par 2 etc… parce que certaine colonnes possèderont G / A et donc on n’aurait plus que des 1…
Quelqu’un aurait il une solution ? Un genre de scripte qui remplacerais les deux valeur de chaque colonne pr 1 et 2 et qui le ferait en boucle pour toute les colonnes ?
Merci de votre aide