Bonjour,
Ce message s'affiche généralement en ouvrant la liste du filtre automatique sur une colonne contenant plus de valeurs qu'Excel ne peut gérer pour ce filtre.
Par défaut dans Excel je ne vois pas comment contourner cette limite hormis en créant plusieurs tableaux dans plusieurs feuilles différentes. Selon les données de ton tableau initial il faut séparer les données de façon logique bien sûr. Par exemple si ton tableau traite de données par pays alors créé des tableaux différents par pays ou groupe de pays mais pas en ne prenant qu'un groupe de lignes au pif.
Sinon tu peux envisager de mettre en place du code VBA qui masquera ou non les lignes adéquates selon certains critères que tu pourras définir. Dans l'exemple précédent on peut imaginer l'apparition d'une fenêtre qui te demande quel pays laisser afficher ou masquer puis le code masquera les lignes adéquates ou même la création automatique d'un "sous tableau" dans une autre feuille ou encore travailler avec les TCD.
C'est un exemple simple de fonctionnalité VBA avec un fichier et une demande plus précise on pourra plus t'aider.