Perso, je me suis posé la même question et j'en suis arrivé à la conclusion qu'il fallait pas cellules fusionnées.
Ce que j'ai fais :
1 - Je laisse tel quel mon premier tableau avec les cellules fusionnées.
2 - J'ai créé un second tableau avec les mêmes valeurs que celles présentes dans le premier tableau mais sans les cellules fusionnées.
3 - A partir de 2nd tableau, j'ai créé un Tableau Croisé Dynamique et ensuite, je peux faire les graphiques et les tris que je veux.
A+