Bonsoir,
Je travaille en ce moment sur un projet de bio informatique. Pour pourvoir utiliser un logiciel de classification des génome et de leur protéines, j'ai besoin d'avoir mon fichier de sortie sous forme CSV.
Tout d'abord, j'ai 1 fichier CSV contenant 3511 nom de génome. (par exemple gen1,gen2 ...).
Mon fichier de sortie doit donc être un fichier csv sous forme de 2 colonnes tel qu'on est toutes les paires possibles
Je prends un exemple avec 3 génomes: au départ on a gen1, gen2 et gen3. mon fichier de sortie est
gen1,gen2;
gen1,gen3;
gen2,gen3
gen2,gen1;
gen3,gen1;
gen3,gen1;
Il s'agit d'un "format classique CSV".
J'ai réalisé sous excel, une macro qui fabrique cette liste sous forme d'un tableau excel sous 2 colonnes (que j'aurais ensuite transformé en CSV). Cependant mon problème est que le nombre de ligne dont j'ai besoin (3511*3510=12 millions et des brouettes) est largement supérieur à ce qu'Excel peut donner.
Il me faudrait donc faire la macro tel que mon résultat soit un fichier CSV. il suffit qu'il existe. je n'ai pas besoin de l'ouvrir pour utiliser le logiciel de classification.
Je vous précise que je ai seulement 1h/2h de VBA.
Voici ma macro (qui fonctionnent tant que la capacité d'Excel le permet : cad pour 100<total<200 <<3511)
Sub Test()
'Déclaration des variables
Dim x As Integer, nom As String, j As Integer, i As Integer, versus As String, total As Integer
total = 10 'nombre total de plasmids 3511
i = 1
j = 1
For x = 1 To total
nom = Cells(x, 1)
Range(Cells(i, 3), Cells(i + total - 2, 3)).Value = nom
i = i + total - 1
For k = 1 To total
versus = Cells(k, 1)
If k <> x Then
Cells(j, 4).Value = versus
j = j + 1
Else
j = j
End If
Next
Next
End Sub
Est ce qu'il serait possible d'avoir le code/de l'aide pour obtenir le fichier de sortie que je cherche ?
Merci d'avance.
Bonne soirée
Bonne soirée à tous.